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Nunes,Claudinéia Ferreira; Ferreira,Juliano Lino; Fernandes,Mônique Carolina Nunes; Breves,Sâmera de Souza; Generoso,Andressa Leal; Soares,Bárbara Dantas Fontes; Dias,Mário Sérgio Carvalho; Pasqual,Moacir; Borem,Aluízio; Cançado,Geraldo Magela de Almeida. |
Several extraction methods of genomic DNA for identification and characterization of genetic diversity in different plant species are routinely applied during molecular analysis. However, the presence of undesirable compounds such as polyphenols and polysaccharides is one of the biggest problems faced during the isolation and purification of high quality DNA in plants. Therefore, achievement of fast and accurate methods for DNA extraction is crucial in order to produce pure samples. Leaves of strawberry genotypes (Fragaria ananassa) have high contents of polysaccharides and polyphenols which increase the sample viscosity and decrease the DNA quality, interfering with the PCR performance. Thereby, in this study we evaluated the quality and amount of genomic... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Fragaria ananassa; Genomic DNA; Polivinilpirrolidone; Lyophilization; PCR. |
Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011000800014 |
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Ferreira Neto,José Mauricio; Ferreira,Fernanda Pinto; Miura,Ana Carolina; Almeida,Jonatas Campos de; Martins,Felippe Danyel Cardoso; Souza,Marielen de; Bronkhorst,Dalton Evert; Romanelli,Paulo Roberto; Pasquali,Aline Kuhn Sbruzzi; Santos,Hannah Lia Ettiene Peruch Lemos dos; Benitez,Aline do Nascimento; Caldart,Eloiza Teles; Zanella,Luiz Francisco; Freire,Roberta Lemos; Navarro,Italmar Teodorico. |
ABSTRACT: The present study aimed to investigate an abortion outbreak in a dairy goat herd in the municipality of Arapoti, Parana, Brazil. At the beginning of the outbreak, blood samples were collected from 33 goats with clinical signs; later, of the whole goat herd, two cats and two dogs. Milk samples were collected from 78 lactating goats. Four environmental soil samples and four samples of feed residue from goat feeders were collected too. Immunofluorescence antibody test (IFA) was used for serodiagnosis, the molecular analysis was conducted by means of the polymerase chain reaction (PCR), for the isolation of the etiological agent the bioassay was used. The results of the IFA revealed that 76.53% (137/179) of the goats, two dogs and two cats were... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Toxoplasma; Goats. IFA; PCR; Bioassay.. |
Ano: 2018 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782018000500500 |
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Dantas, Liliane de Oliveira; Garcia, Rita de Cássia N. Cubel; Miranda, Suzana Carvalho de; Haanwinckel, Maria Cristina Santos; Menini, Rodrigo; Megid, Jane. |
O presente estudo teve por objetivo diagnosticar a parvovirose em cães clinicamente suspeitos, utilizando-se a reação em cadeia pela polimerase (PCR) e hemaglutinação (HA) para identificação do agente. Foram examinadas 38 amostras fecais de cães SRD, de ambos os sexos, com idade entre três a sete meses, atendidos no hospital veterinário da FMVZ-UNESP/Botucatu, apresentando suspeita clínica de parvovirose, em presença de quadro de diarreia sanguinolenta, êmese, anorexia, apatia, hipertermia e leucopenia. As amostras fecais foram coletadas por meio de sonda, armazenadas em eppendorfs e congeladas até o processamento. Entre as amostras examinadas, 23 foram positivas para PCR e 21 positivas para HA, independente do animal ter ou não recebido pelo menos uma... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Cães; Parvovirose; PCR; HA. |
Ano: 2013 |
URL: http://www.revistamvez-crmvsp.com.br/index.php/recmvz/article/view/18635 |
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Flôres,Maristela Lovato; Nascimento,Vladimir Pinheiro do; Kader,Ivonyr Irene Tróglio Abdel; Cardoso,Martha; Santos,Luciana Ruschel dos; Lopes,Rui Fernando Félix; Wald,Vera Beatriz; Barbosa,Taylor Marcelo Corrêa. |
A identificação de poedeiras comerciais infectadas por salmonelas tem sido um dos pontos fortes da profilaxia e conseqüente redução de surtos de salmonelose em humanos associados ao consumo de ovos, sendo que a análise dos ovos pode ser mais um dos pontos de detecção da infecção, que, muitas vezes, cursa sem sinais clínicos. A Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) parece ser uma estratégia útil para detecção de Salmonella, pois vários autores têm utilizado a PCR para verificar a presença da bactéria em carnes, fezes, tecidos, sangue, leite e ovos, com diferentes metodologias de manipulação das amostras. Foram analisados 360 ovos, procedentes de dez propriedades rurais, produtoras de ovos tipo colonial, no distrito de Camobi, em Santa Maria - RS. Os ovos... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Salmonelas; Ovos coloniais; PCR. |
Ano: 2003 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782003000300025 |
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Faria,F.J.C.; Guimarães,S.E.F.; Lima,R.M.G.; Mourão,G.B.; Pinheiro,L.E.L.. |
Informações sobre peso à desmama de um rebanho Nelore foram utilizadas após ajuste para idade padrão de 205 dias, sexo da cria, idade da mãe, touro e mês de desmama, para separar as reprodutrizes em dois grupos, cujos filhos diferiam nesse peso. As médias ajustadas pelo método dos quadrados mínimos foram para os grupos pesado (P) e leve (L) de 163,21± 2,18kg e 134,44± 2,18kg, respectivamente, com 41 animais em cada grupo. Essas reprodutrizes foram submetidas à coleta de sangue para estudo de polimorfismos do gene da somatotropina bovina, pela técnica de PCR-RFLP (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism). A amplificação de uma região entre o éxon III e V do gene da somatotropina permitiu analisar dois sítios de restrição. Para o... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Bovino; Somatotropina; PCR; RFLP; Polimorfismo genético. |
Ano: 1999 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09351999000600011 |
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Faria,F.J.C.; Guimarães,S.E.F.; Mourão,G.B.; Lima,R.M.G.; Pinheiro,L.E.L.. |
Informações sobre peso à desmama de bezerros Nelore foram utilizadas após ajuste para idade padrão aos 205 dias, sexo, idade da mãe, touro e mês de desmama, para separar as reprodutrizes em dois grupos, segundo o peso de suas crias. As médias de peso dos bezerros ajustadas pelo método dos quadrados mínimos e erros-padrão (LSM± SE) foram para os grupos pesados (P) e leves (L) 163,21± 2,18kg e 134,44± 2,18kg, respectivamente, com 41 animais em cada grupo. Essas reprodutrizes foram submetidas a coleta de sangue para estudo de polimorfismos do gene da beta-lactoglobulina, por meio da técnica de PCR-RFLP. A amplificação e a digestão de um fragmento do gene da beta-lactoglobulina entre o éxon II e III identificou os genótipos 1AA, 24AB e 56BB, com as freqüências... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Bovino; Nelore; Beta-lactoglobulina; PCR; RFLP; Polimorfismo genético. |
Ano: 2000 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352000000300016 |
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Binneck,Eliseu; Nedel,Jorge Luiz; Dellagostin,Odir A. |
Caracteres morfológicos têm sido utilizados tradicionalmente como assinaturas da identidade e pureza varietal e genética. Esses descritores se constituem em uma base pobre, por ser uma medida indireta da composição genética do material. Uma vez que caracteres moleculares revelam diferenças genéticas mais rapidamente, com maior precisão e sem o obscurecimento causado pelo efeito ambiental, oferecem vantagens significantes em termos de discriminação, confiabilidade, rapidez e custo reduzido. Um método molecular relativamente novo, DNA polimórfico amplificado ao acaso (RAPD), baseado na reação em cadeia da polimerase (PCR), tem sido adotado por alguns pesquisadores envolvidos no desenvolvimento de métodos de identificação de cultivares principalmente por ser... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: DNA polimórfico amplificado ao acaso (RAPD); Reprodutibilidade; Marcadores moleculares; PCR. |
Ano: 2002 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0101-31222002000100027 |
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Schierholt,A.S.; Fonseca,I.; Silva,P.V.; Paiva,S.R.; Chaves,L.C.S.; Lopes,P.S.; Faria,D.A.; Guimarães,S.E.F.. |
Estudou-se a filogenia do gene da miogenina, um membro da família MyoD, reguladora da miogênese, que ocorre durante o desenvolvimento embrionário, e sua história evolutiva em espécies domésticas que apresentem seqüências de DNA depositadas no Genbank, comparando-se o índice de substituição de nucleotídeos não-sinônimos pelo índice de substituição sinônima. Valores maiores do que um (1) indicaram que o gene sofreu mudanças que tornaram o organismo mais adaptado ao ambiente. As árvores filogenéticas foram obtidas por máxima verossimilhança, e os índices de substituição sinônima e não-sinônima foram analisadas pelo método de parcimônia. Os resultados indicaram que, provavelmente, o gene sofreu evolução adaptativa no grupo Ruminantia, Bos taurus e Ovis aries,... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Miogênese; Seqüenciamento de DNA; PCR. |
Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352008000100022 |
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Castro Castro,Fernando Favian; Muñoz Flores,Jaime Eduardo; Uieda,Wilson. |
En los municipios La Victoria, Águila, Obando, Cartago, Zarzal, San Pedro, Cerrito y Palmira del departamento Valle del Cauca; Mercaderes en el Cauca; y Puerto Nariño en el departamento del Amazonas, se realizó el análisis de filogenia del murciélago hematófago Desmodus rotundus. Las muestras de tejido epitelial fueron tomadas en el patagio del quiróptero, amplificadas por PCR utilizando cebadores 16SL y 16SH, se amplificó ADN mitocondrial, y se secuenciaron 50 individuos de murciélagos hematófagos. Después de la secuenciación se encontraron ocho haplotipos y se encontró que el más frecuente se presenta en 43 individuos. Se utilizaron dos métodos, máxima verisimilitud y parsimonia. Utilizando el Genbank se revisaron secuencias de marcadores mitocondriales... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: ADN; Clados; Genbank; Haplotipos; Patagio; PCR; 16SL; 16SH. |
Ano: 2016 |
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122016000100010 |
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Flores,Mariana Martins; Mazaro,Renata Dalcol; Langohr,Ingeborg Maria; Roy,Alma; Strother,Keith; Fighera,Rafael Almeida. |
ABSTRACT: The use of histologic classification by a 2-tier grading system only, immunohistochemistry (IHC) for KIT and Ki-67 and polymerase chain reaction (PCR) for internal tandem duplications (ITD) on exon 11 has improved the prognostication of canine cutaneous mast cell tumors (CCMTs) particularly in the United States. However, these techniques are not commonly used in most Brazilian laboratories. Likewise, no studies, to date, have investigated the occurrence of ITD in CCMTs from the country. Thus, this study tested the 2-tier grading system, the immunohistochemistry for KIT and Ki-67 and the PCR for exon 11 in a group of Brazilian CCMTs with the goal of investigating the applicability of these tests in a Brazilian laboratory. Of the 39 CCMTs, 69.2%... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Immunohistochemistry; Ki-67; Mutations; PCR; Mast cell tumor.. |
Ano: 2016 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782016001001804 |
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Espinosa,Ivette; Báez,M; Vichi,J; Martínez,Siomara. |
Pasteurella multocida is an important veterinary pathogen that causes a range of animal diseases, including fowl cholera, hemorrhagic septicemia in cattle and atrophic rhinitis in swine. P. multocida is generally recognized as a secondary invader contributing substantially to respiratory diseases in pigs by aggravation of lung lesions. Five capsule serogroups are routinely identified in P. multocida (A, B, D, E, and F) and each is generally associated with, but not completely restricted, to a specific host. A total of 16 isolates of Pasteurella multocida capsular genotype A and two isolates capsular genotype D were characterized for their susceptibilities to 10 antibiotics and the presence of four genes for virulence factors associated to adherence. The... |
Tipo: Journal article |
Palavras-chave: P. multocida; Virulence factor; PCR; Antimicrobial susceptibility. |
Ano: 2012 |
URL: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0253-570X2012000300003 |
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Martínez Bolaños, Misael. |
El litchi (Litchi chinensis Soon) es un fruto subtropical. El cultivar Brewster se explota comercialmente en la región del Papaloapan y el cv. Mauritius en los Bajos Mixes, Oaxaca, México. El manchado del pericarpio es uno de los problemas principales en pre y postcosecha del fruto en ambos cultivares. No se han encontrado registros de su causa o importancia en México, por ello los objetivos de esta investigación fueron: determinar la etiología del manchado café del pericarpio e iniciar la exploración del control in vitro de su agente causal. La antracnosis o manchado del pericarpio del litchi se caracterizó externa e internamente por lesiones circulares de color café, con márgenes bien definidos en el pericarpio, pero sin afectar el arilo o la semilla.... |
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Palavras-chave: Brewster; Mauritus; Pathogenicity; Incidence; PCR; Patogenicidad; Incidencia; Antracnosis; Benomil; Procloraz; Hidróxido de cobre; Doctorado; Fitopatología. |
Ano: 2012 |
URL: http://hdl.handle.net/10521/1701 |
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Teodoro,V.A.M.; Pinto,P.S.A.; Vanetti,M.C.D.; Bevilacqua,P.D.; Moraes,M.P.; Pinto,M.S.. |
Avaliou-se a contaminação de carcaças e tonsilas de suínos por Y. enterocolitica em estabelecimentos de abate não inspecionados, comparando a pesquisa microbiológica convencional com a técnica da reação em cadeia de polimerase (PCR) e o tipo de amostra analisada (de tonsila ou de carcaça), como subsídio ao monitoramento microbiano em sistemas de análise de perigos e pontos críticos de controle. Calcularam-se os custos dos dois testes. Não se detectou Y. enterocolitica pela técnica microbiológica convencional, mas, pela técnica de PCR foi possível detectar a bactéria em 40% das carcaças e em 43% das tonsilas, incluindo cepas patogênicas nas tonsilas. Não houve diferença entre os resultados positivos para as amostras de tonsilas e esfregaços de superfície... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Suíno; Contaminação; Yersinia enterocolitica; PCR; APPCC. |
Ano: 2006 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352006000100002 |
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